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藥品的凍干過程包括樣品準備、預凍、一次干燥（升華干燥）和二次干燥（解析干燥）、密封保存等五個步驟，每個階段都要嚴格控制溫度、冷凍速度和真空度。筆者了解到，影響藥品凍干過程的因素很多，而且各因素相互之間還存在著相關作用。因此，要得到良好的凍干藥品，還需要對凍干過程中各環節進行有效控制。
比如在產品處方方面，相關_表示，要_凍干效果，處方是首先需要解決的問題，因為處方是進行凍干工藝研究的基礎。當藥品處方不同時，那么熔點、殘余水分要求都會不同。共熔點低的產品，要求預凍的溫度也低，加熱時板層的溫度會相應低些。水分含量要求低的產品，凍干時間也要長些，水分含量要求高的產品，凍干時間則會縮短。
另外，在凍干之前，操作者要對原料、輔料等做充分的研究，如盡量選擇共熔點較高的凍干保護劑以利于升華階段的順利進行，縮短凍干時問。要選擇合適的抗氧化劑、酸堿調節劑以_制品的穩定性等。
相關人士表示，當處方中固體物質少于2%時，凍干產品在干燥過程中可能會出現破裂，甚至是脫離容器的現象。而如果少于30%，凍干產品的濃度_會變高，阻礙干燥過程中水蒸氣的流動，從而導致凍干時間的延長或是終產品水分的偏高。
產品預凍也是一個重要環節。通常情況下，產品在進行冷凍干燥時，要裝入適宜的容器進行預先凍結，然后才能進行升華干燥。需要提醒的是，預凍其實是凍干過程中較為重要的一個環節，因為預凍過程不僅是為了保護物質的主要性能不變，還是為了產品在凍干后有合理的結構以利于水分的升華。因此，在預凍之前需要確定三個因素，即預凍的低溫度、預凍的速度和預凍的時間。
在預凍速度方面，預凍速度的快慢可直接影響隨后的升華干燥過程，主要有慢凍和速凍兩種方式。慢凍方面，一種是較長時間達到凍結溫度;另一種是在共晶點附近（粥狀冰）維持一段時間，再下降溫度。速凍有三種方式，一種是產品進凍干機后，機器全速制冷;_種是產品進凍干機后，維持板溫 0°C左右（以制品不結冰為準），使制品處于液態較低的溫度，然后機器全速制冷;第三種是先制冷板層至-30°C至-35 °C ，再放入制品，機器全速制冷。
在預凍時間方面，_表示要根據機器的情況來決定 ，要_抽真空之前所有產品均已凍實。因抽真空而冒出瓶外，凍干腔體的每一擱板之間，每一擱板的各部分之間溫差越小，則預凍的時間可以相應縮短，一般產品的溫度達到預凍低溫度之后1~2h即可開始抽真空升華。
如果能注意上述因素，藥品的凍干過程會較為順利。良好的凍干藥品一般有著良好的物理形態，比如外形飽滿、表面平整、不萎縮、色澤均勻、多孔性好、水分含量合格、加水后能迅速復溶、能長期存放等。
